Salah satu momok dari budidaya vanili adalah penyakit busuk batang vanili (F. oxysporum f. sp. Vanilla). Pasalnya jenis fusarium dapat mengakibatkan kematian tanaman secara sporadis dan ironisnya lahan yang sudah menjadi endemik penyakit ini tidak dapat ditanami selama 5 tahun, karena pasti akan terkena busuk batang.

Kabar baiknya Balai Penelitian Tanaman Obat dan Rempah, Bogor telah merilis varietas vanili unggul Sovania Agribun dengan keunggulan produksi tinggi dan tahan terhadap penyakit busuk batang vanili. Untuk produksi bisa mencapai 1,31 – 1,74 kg/tanaman polong basah, dan bobot kering mencapai 0,45 – 0,60 kg/tanaman atau setara dengan produksi 1,4 – 1,8 ton vanili kering/ha. Dengan kandungan vanillin hingga 3,12 persen sementara rata-rata vanili di petani di angka 2 persen.